符合高新技術企業(yè)認定條件的企業(yè)可以自己整理申請需要的材料到認定機構自己申請，也可以通過專業(yè)的代理機構代理申報。
企業(yè)登錄“高新技術企業(yè)認定管理工作網(wǎng)”，對照第10條規(guī)定自我評價；
申請人進入“高新技術企業(yè)認定管理工作網(wǎng)”注冊用戶并填寫提交認定申請表；
提交紙質版的申請表以及申報指南提及的相關資料給認定機構：如深圳市企業(yè)提交給深圳科創(chuàng)委；
深圳科創(chuàng)委在符合評審要求的專家中隨機抽取專家組成專家組對申報材料進行評審并提出意見；
結合專家組評審意見，對企業(yè)進行綜合審查，專家組提出認定意見并報給領導小組辦公室；
領導小組辦公室在“高新技術企業(yè)認定管理工作網(wǎng)”公示10個工作日，無異議的，予以備案，并在“高新技術企業(yè)認定管理工作網(wǎng)”公告；
由認定機構向企業(yè)頒發(fā)“高新技術企業(yè)證書”；
企業(yè)就可以辦理相關補貼和優(yōu)惠手續(xù)了。
1、《高新技術企業(yè)認定申請書》；
2、企業(yè)的《營業(yè)執(zhí)照》等相關注冊登記證件的復印件；
3、知識產(chǎn)權相關材料（證書及技術水平的證明材料等）、科研項目立項證明（項目驗收或結題報告）、科技成果轉化、研究開發(fā)組織管理（總體情況與四項指標符合情況的具體說明）等相關材料；
4、企業(yè)高新技術產(chǎn)品的核心技術和技術指標的具體說明，相關的生產(chǎn)批文、認證認可和資質證書、產(chǎn)品質量檢驗報告等材料；
5、企業(yè)職工和科技人員占比情況，包括在職、兼職和臨時聘用人員人數(shù)、人員學歷結構、科技人員名單及其工作崗位等；
6、經(jīng)專業(yè)且符合條件的中介機構出具的企業(yè)近三個會計年度（不足三年的按實際經(jīng)營年限）研究開發(fā)費用、近一個會計年度高新技術產(chǎn)品收入專項審計或鑒證報告以及研究開發(fā)活動說明材料；
7、經(jīng)專業(yè)的中介機構鑒證的企業(yè)近三個會計年度的財務會計報告（包括會計報表、附注和財務情況說明書）；
8、近三個會計年度企業(yè)所得稅年度納稅申報表（主表及附表）。
高新技術企業(yè)的認定標準是采取的百分制的評分制，達到70分以上即可認定通過。
1、核心自主知識產(chǎn)權：企業(yè)擁有的核心自主知識產(chǎn)權的數(shù)量（不含商標）；如果想要拿到30分滿分的話，企業(yè)需要有4個**著作權登記證書或者1個發(fā)明專利或者3個實用新型專利；
2、科技成果轉化能力：最近3年內(nèi)科技成果轉化的年平均數(shù)需四項以上；如果想要拿到30分滿分的話，就從12個技術開發(fā)合同（分別針對不同產(chǎn)品）或12個技術服務合同或12個銷售合同等入手；
3、研究開發(fā)的組織管理水平：如果想要拿到20分滿分的話，需要以下五個小項全部齊全；
1）研究開發(fā)項目立項報告；
2）研發(fā)投入核算體系；
3）產(chǎn)學研合作的研發(fā)活動；
4）具備相應的設施和設備的研發(fā)機構；
5）研發(fā)人員的績效考核獎勵制度。
4、成長性指標：反映企業(yè)經(jīng)營績效的指標，具體分為總資產(chǎn)增長率和銷售增長率；如果想要拿到20分滿分的話，總資產(chǎn)和銷售每年是遞增的。
